Начисление бонусов за вычетом оплаты бонусами

Частый вопрос: как сделать так, чтобы бонусы начислялись на сумму, за вычетом оплаты заказа бонусами?

Например: 
Стоимость заказа 1000 руб.
Заказ оплачен бонусами в размере 100 руб.
Установлены настройки начислений 10%.
Необходимо, чтобы на заказ начислялось 90 руб. (900 * 10%).

Необходимо в настройках модуля установить, что оплата бонусами - это скидка, а не частичная оплата!
Инструкция

Если в настройках установлено, что оплата бонусами - это частичная оплата заказа, то учесть данные бонусы в начислении не возможно по логическим причинам!

Почему:
Бонусы начисляются на товары, а оплачивается бонусами заказ.

Например:
Состав заказа:
товар 1: 700 руб, 1 шт = 700 руб.
товар 2: 300 руб, 1 шт = 300 руб.
Итого: 1000 руб.

Должно начислиться бонусов по заказу:
товар 1: 700*10% * 1шт = 70 руб.
товар 2: 300*20% * 1шт = 60 руб.

Оплачиваем заказ бонусами в размере 100 руб.
Вопрос: а какой из товаров считать оплаченным бонусами?
За разные товары могут быть разные бонусы.

Поэтому, учет оплаты бонусами логически возможен только при распределении оплаты бонусами в виде скидки на товары.